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芬蘭科學(xué)家利用轉(zhuǎn)錄組測(cè)序揭示前列腺癌中重要調(diào)控因子

發(fā)布時(shí)間：2015-08-29作者：諾為爾基因瀏覽次數(shù)：3242

芬蘭科學(xué)家利用轉(zhuǎn)錄組測(cè)序揭示前列腺癌中重要調(diào)控因子

 
   近日，芬蘭坦佩雷理工大學(xué)科學(xué)家Antti Ylip??等利用高通量測(cè)序技術(shù)對(duì)前列腺癌患者進(jìn)行轉(zhuǎn)錄組測(cè)序，發(fā)現(xiàn)前列腺癌中的重要調(diào)控lncRNA——PCAT5，PCAT5可作為去勢(shì)難治性前列腺癌（CRPC）的生物分子標(biāo)記。文章于2015年8月17日發(fā)表在Cancer Research（影響因子9.329）雜志上。

前列腺癌是男性常見(jiàn)惡性腫瘤，在某些國(guó)家和地區(qū)發(fā)病率高于肺癌等居首位，并呈逐年上升的趨勢(shì)。對(duì)于前列腺癌患者在診斷時(shí)大多已發(fā)展到中晚期，雖然通過(guò)內(nèi)分泌治療可以使病情得到緩解，但多數(shù)前列腺癌患者會(huì)發(fā)展成去勢(shì)難治性前列腺癌，去勢(shì)難治性前列腺癌患者預(yù)后極差。去勢(shì)難治性前列腺癌是國(guó)際醫(yī)學(xué)界面臨的科學(xué)難題，缺乏有效的治療手段。

Antti Ylip??等通過(guò)高通量測(cè)序手段，利用Illumina公司HiSeq 2000測(cè)序平臺(tái)對(duì)12個(gè)良性前列腺增生（BPHs）患者樣本、28個(gè)未經(jīng)治療的前列腺癌（PCs）患者樣本和13個(gè)去勢(shì)難治性前列腺癌（CRPCs）患者樣本進(jìn)行轉(zhuǎn)錄組測(cè)序。本研究新發(fā)現(xiàn)145個(gè)未經(jīng)注釋的lncRNA或同源異構(gòu)體（isoform）序列，其中三分之一的序列為CRPCs特有。

作者發(fā)現(xiàn)PCAT5為特異性的lncRNA，僅存在于靶標(biāo)轉(zhuǎn)錄因子ERG-positive前列腺癌患者樣本和去勢(shì)難治性前列腺癌患者樣本中，PCAT5作為新發(fā)現(xiàn)的致瘤lncRNA，調(diào)節(jié)靶標(biāo)轉(zhuǎn)錄因子，并參與細(xì)胞的生長(zhǎng)、遷移和細(xì)胞凋亡等。

此外，利用聚類分析和主成分分析等方法揭示不同樣本之間關(guān)鍵通路的基因表達(dá)量變化；對(duì)前列腺癌樣本和去勢(shì)難治性前列腺癌樣本中新發(fā)現(xiàn)的差異表達(dá)lncRNA的表達(dá)量進(jìn)行檢測(cè)；抑制PCAT5的表達(dá)會(huì)導(dǎo)致ERG-positive前列腺癌細(xì)胞的生長(zhǎng)、遷移能力的降低。

本文通過(guò)轉(zhuǎn)錄組測(cè)序?yàn)槿?shì)難治性前列腺癌提供生物分子標(biāo)記，對(duì)臨床治療具有重要的指導(dǎo)意義。

原文索引：

http://cancerres.aacrjournals.org/content/early/2015/08/15/0008-5472.CAN-15-0217.full.pdf+html?sid=03a5406c-8876-4535-b0f3-09a219dfc537