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新聞動態(tài)

運用高通量測序的方法談談《穹頂之下》霧霾的那些事

發(fā)布時間:2015-03-06作者:諾為爾基因瀏覽次數(shù):3214


著名主持人柴靜的《穹頂之下》用近乎完美的動畫給我們形象展示了霧霾中PM2.5的化學成分,作為本周的熱議話題。生物學研究者也早從另一角度,通過高通量測序的方法揭示了可吸入微生物的致病情況,兩者相互結合使廣大群眾對霧霾有了更全面的認識。

著名主持人柴靜不惜支出個人百萬存款制作《穹頂之下》,整片用近乎完美的動畫,歷時100分鐘向廣大群眾展示了PM2.5的化學成分,使大眾的環(huán)保意識重重的duang了一下。廣大群眾對于霧霾幾年的積怨終于無法抑制的爆發(fā)了。各種不能忍,各種恨天黑,各種毒霧霾將我們的微信和微博給天天刷爆了。

既然大眾對霧霾如此深惡痛疾,作者利用《穹頂之下》的熱潮,匯總生物學方面的研究將霧霾的另一面展示給大眾——霧霾中微生物的那些事。

對于霧霾,柴靜已對PM2.5的化學成分分析得非常專業(yè)??墒侨绻詾殪F霾只有這一把菜刀就能有這么大的陣仗,那我們就天真了。致病菌是霧霾的另一個健康殺手。

在2014年的1月,清華大學在《Environmental Science & Technology》上發(fā)表了關于北京PM2.5與PM10污染物中可吸入微生物的研究結果。眾所周知,空氣中有一些微生物是容易引起人類過敏和呼吸系統(tǒng)疾病的,主要包括肺炎鏈球菌,煙曲霉菌以及人類腺病毒C。研究結果顯示:在霧霾較嚴重的時間,相對于低霧霾時間段,肺炎鏈球菌的豐度增加了約兩倍;曲霉菌增加了約4倍;腺病毒的豐度也有較明顯的變化。

此次研究中,清華大學的曹晨等人通過空氣過濾器濾膜對北京地區(qū)霧霾發(fā)生期間每天的顆粒物進行收集,并連續(xù)監(jiān)控7天。研究者把顆粒物中提取的微生物DNA通過高通量測序平臺Illumina Miseq和Hiseq進行測序,并進行微生物多樣性分析,揭示了霧霾期間,空氣中附著在顆粒物的微生物組成情況,以及其豐度情況。

研究者通過與土壤、糞便、淡水以及海洋的微生物多樣性進行比較,發(fā)現(xiàn)北京地區(qū)霧霾期間的空氣微生物組成與土壤和糞便更相近,故推測空氣中微生物主要來源于土壤。這可能與北京植被覆蓋率低、干燥的天氣、裸露的土地以及周邊地區(qū)的建筑工地有關。

本篇總結:顆粒物中85%左右的細菌都來自于土壤和糞便,約1300種,絕大多數(shù)是不致病的。致病菌在微生物大軍中只是小小的一部分(肺炎鏈球菌,0.024%-0.05%;曲霉菌,1.5%-5.8%)。但是這些致病菌的變化是不是我們在霧霾天呼吸道疾病增加的原因,還需要進一步的研究確定。